Микроскоп электронный (Electron Microscope) - микроскоп, в котором для наблюдения в качестве источника излучения используется поток электронов. Разрешающая способность этого микроскопа (способность точно различать отдельные детали) в тысячу раз превышает разрешающую способность обычного светового микроскопа. Образцы должны исследоваться в вакууме, что требует специфических приемов подготовки к проведению исследования, а электроны обычно фокусируются на флуоресцирующем экране (при непосредственном наблюдении) или на фотопластинке (при фотографировании образцов или проведении электронной микрографии (electron micrograph)). Трансмиссионный электронный микроскоп (transmission electron microscope) применяется обычно для изучения тонких срезов тканей при большом увеличении. Сканирующий электронный микроскоп (scanning electron microscope) позволяет наблюдать поверхности различных изучаемых объектов с различным увеличением, его основным преимуществом является возможность очень хорошей фокусировки (и объемность изображения).